Хотя основная критика искажения Писания адресована иудеям, это не означает, что Инджил не был изменён. Из некоторых признаков и косвенных выражений в Коране видно, что христиане также исказили Инджил. В аятах говорится, что Всемогущий Аллах взял завет с тех, кто называет себя христианами, но несмотря на это, они не сдержали своего слова и забыли часть истины, которой они были обучены. По этой причине между ними возникла нескончаемая вражда и ненависть. 

Составители Евангелия заменили единобожие Троицей, исказив тот факт, что досточтимый Иса был пророком, избранным из людей, они считают его богом в теле человека. В Коране говорится, что эти убеждения являются ересью и не соответствуют логике и откровению (Маида, 5/13-14; 75, 116). Таким образом, в общих вопросах, затронутых Кораном и Евангелием, имеющимся на сегодняшний день, есть фундаментальные различия. Содержащиеся в Евангелие основные христианские убеждения, которые заключаются в том, что досточтимый Иса является богом, в вере в Троицу и в смерть пророка Исы на кресте в искупление человеческих грехов, не могут быть приняты с точки зрения Ислама. Эти обстоятельства, противоречащие Корану, указывают на то, что произошла подтасовка. 

Христиане верят в то, что пророк Иса не писал и не велел записывать хоть какую-либо книгу. Таким образом, Новый Завет, составленный после него, был написан без наблюдения и контроля со стороны досточтимого Исы. Люди, писавшие Евангелия, лично не видели события, которые они описывали. Они описали традицию, передаваемую из поколения в поколение, по крайней мере, через полвека после смерти пророка Исы. Кроме того, Евангелия, написанные Матфеем, Марком, Лукой и Иоанном спустя много времени после смерти досточтимого Исы, были записаны на арамейском языке, языке пророка Исы. Но самое старое Евангелие из существующих на сегодняшний день экземпляров написано на древнегреческом языке. Представители этой религии основывают подлинность Евангелия на понятии вдохновения. Согласно их убеждению, составители Нового Завета писали свои Евангелия под наблюдением Святого Духа, и благодаря влиянию Святого Духа эти экземпляры обрели подлинность. Но, согласно Исламу, утверждение о том, что книга написана только на основе вдохновения, не делает её священной или подлинной. Поэтому существующие Евангелия не обладают свойством истинного Инджила. Действительно, исследования показывают, что ни одно из Евангелий не была написана апостолами, включая Матфея и Марка, которые считаются самыми старыми. Таким образом, Инджил, так же как и Таурат, подвергся искажению. 

Католические комментаторы утверждают, что четыре Евангелия написаны истинным духом, который не обманывает и не противоречит, проявляя правдивость даже в деталях. Но между Евангелиями есть противоречия, которые сложно объяснить. Например, не совпадают имена и числа, относящиеся к родословной пророка Исы, которые приведены в Евангелии от Матфея (1/1- 17) и Евангелии от Луки (3/23-38). Согласно Евангелию от Матфея (20/30), когда пророк Иса выходил из Иерихона, к нему с просьбой исцелить глаза обратились два слепых, а согласно Евангелию от Марка (10/46) – один. Согласно Евангелию от Матфея (4/12-17) и Марка (1/14-15), досточтимый Иса стал пророком после того, как Яхья (Иоанн) был заключён в тюрьму, а в соответствии с Евангелием от Иоанна (3/22-26) – до тюремного заключения. Кроме того, касательно личности пророка Исы в разных экземплярах содержатся такие разнообразные утверждения, как то, что он – сын Адама, Давуда (Давида), Юсуфа (Иосифа) и Бога. Точно так же есть разные мнения о том, относить Евангелие к Аллаху или к Исе. 

Мусульмане верят, что Аллах ниспослал пророку Исе Писание под названием Инджил (Евангелие). Но сегодня тексты Евангелия от Матфея, Марка, Луки и Иоанна, которые входят в Библию, не являются подлинным Инджилом, ниспосланным пророку Исе. Сегодня нет Инджила в его подлинном виде. Мусульмане принимают стихи имеющегося сегодня Евангелия, которые соответствуют Корану и достоверным хадисам, отвергая те, которые противоречат им. В вопросах, которые не упоминаются в аятах и хадисах и не противоречат основным принципам, они действуют в соответствии с наставлением Пророка Мухаммада: «Не подтверждайте то, что у обладателей Писания, и не опровергайте. А только говорите: ‘‘Мы уверовали в Аллаха, а также в то, что было ниспослано нам и что было ниспослано вам’’» (Бухари, И'тисам, 25).

Священный Коран сообщает, что в Таурате и Инджиле написано, что досточтимый Мухаммад будет послан как пророк: «Они последуют за посланником, неграмотным (не умеющим читать и писать) пророком, запись о котором они найдут в Таурате и Инджиле»(Араф, 7/157). И пророк Иса обращался к своей общине: «О сыны Израиля! Я послан к вам Аллахом, чтобы подтвердить правдивость того, что было в Таурате до меня, и чтобы сообщить благую весть о Посланнике, который придёт после меня, имя которого будет Ахмад»  (Сафф, 61/6).

 Исламские учёные отмечают, что эта весть была в Инджиле, ниспосланном пророку Исе, но позже в результате искажений она была удалена из священных текстов. Вместе с тем они также говорят о том, что в существующем Евангелии всё-таки остались сведения о пророке Мухаммаде. Вот некоторые из отрывков, содержащихся в Новом Завете, где есть сведения о приходе досточтимого Мухаммада как пророка: Евангелие от Матфея, 4/17, 6/10, 10/7, 13/31-32, 21/43; Евангелие от Луки, 9/2, 10/9; Евангелие от Иоанна, 1/15, 15/26-27, 16/7, 13-14. 

В Новом Завете, особенно в Евангелии от Иоанна, среди вестей о Пророке Мухаммаде бросается в глаза слово «Параклит», которое переводится как «заступник, утешитель». Стихи о Параклите, в которых пророк Иса предвещает будущее, звучат следующим образом: 

«Если вы любите Меня, то будете исполнять мои заповеди. Я же умолю Отца, и Он пошлёт вам другого Заступника, чтобы он навеки остался с вами. Тот Заступник – Дух истины, мир его принять не способен, потому что не видит его и не знает. Вы же знаете его, поэтому он останется среди вас и (всегда) будет с вами» (Евангелие от Иоанна, 14/15-17).

«Заступник же, Святой Дух, которого Отец пошлёт вам во имя меня, научит вас всему и напомнит вам всё, о чём я вам говорил» (Евангелие от Иоанна, 14/26).

«Когда придёт Заступник – Дух истины, которого я пошлю к вам и который исходит от Отца, он будет свидетельствовать обо мне» (Евангелие от Иоанна, 15/26).

«Но правду вам говорю, что для вас будет лучше, если я уйду. Потому что если я не уйду, то Заступник не придёт к вам. Если же я уйду, то пошлю его к вам. Когда он придёт, то обличит мир в его неправильном суждении о грехе, о праведности и о суде»  (Евангелие от Иоанна, 16/7-8).

«Ещё многое я могу вам сказать, но сейчас вам это не под силу. Вот когда Дух истины придёт, он введёт вас во всю полноту истины. Он не будет говорить от себя. Но будет передавать то, что сам слышит, и скажет вам, что должно произойти»  (Евангелие от Иоанна, 16/12).

В приведённых выше примерах слово «Параклит» в Евангелии от Иоанна, переведенное как «Заступник», является древнегреческим. Параклит имеет такие значения, как «утешающий, призванный на помощь, защитник, заступник». По мнению христианских учёных, под этим словом подразумевается Святой Дух. Соответственно, апостолам, которые были опечалены тем, что Мессия (Иса) уходит от них, для утешения был послан Святой Дух. 

Тогда как исламские учёные отмечают, что под этим словом подразумевается пророк Мухаммад. Невозможно интерпретировать слово Параклит как Святой Дух. Потому что для появления Святого Духа нет необходимости того, чтобы «Иса уходил»  (Евангелие от Иоанна, 16/ 7-8). Потому что, по мнению христиан, Святой Дух находился с верующими как до пророка Исы, так и после него. 

Слова из Евангелия от Иоанна: «... Он не будет говорить от себя. Но будет передавать то, что сам слышит, и скажет вам, что должно произойти»  (Евангелие от Иоанна, 16/12), – не применимы в отношении Святого Духа. Потому что, согласно Христианству, Святой Дух – это сам Бог. Если это так, то он бы говорил от себя, и не нужно было бы слышать слова Бога, чтобы передавать их. 

В Евангелии это слово выражено конкретными глаголами, такими как «слышать» и «говорить» (Евангелие от Иоанна, 16/13 и др.). Которые могут быть использованы только в отношении того, у кого есть органы слуха и речи. Подобные качества нельзя приписывать Святому Духу. Ибо Святой Дух – ангел откровения и вдохновения. Для вдохновения эти органы не нужны.

По этим и другим похожим причинам неверно под Параклитом понимать Святой Дух. Понятно, что Параклит – это человек, подобный пророку Исе, в то время как фраза «Святой Дух» была приписана позже как дополнение. Кроме того, исламские учёные исследовали значение этого слова на арамейском языке, на котором говорил досточтимый Иса, и пришли к выводу, что это слово совпадает по смыслу со словом Ахмад. (Мехмет Айдын, «Параклит», ИЭ РФТ, XII, с. 165-166.)

Наконец, из следующих утверждений видно, что иудеи верят, что после Христа и Ильяса (Илии) придёт другой пророк: 

«И вот свидетельство Иоанна. Когда иудеи послали из Иерусалима священников и левитов спросить у него, кто он такой. Иоанн сказал им открыто, не уклоняясь от ответа: ‘‘Я – не Христос’’. Они спросили его: ‘‘Тогда кто же ты? Ты Илия?’’ ‘‘Нет’’, – ответил он. ‘‘Может быть, ты – пророк, которого мы ждём?’’ – был следующий вопрос. Он ответил: ‘‘Нет’’. ‘‘Кто же ты? – продолжали они спрашивать. – Мы должны дать ответ тем, кто нас послал. Кем ты сам себя называешь?’’ Он ответил им словами пророка Исайи: ‘‘Я – глас вопиющего в пустыне, говорящий, чтобы вы проложили Господу прямой путь!’’»  (Евангелие от Иоанна, 1/19-23).